ComplexHeatmap 之 Legends 续（一）

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匆匆又夏天

2、离散型图例

离散图例用于离散颜色映射。通过仅提供颜色和中断值，连续颜色映射也可以转换为离散颜色映射。

可以指定 at 或 labels，但大部分指定标签。颜色应由 legend_gp 指定：

lgd = Legend(at = 1:6, title = "foo", legend_gp = gpar(fill = 1:6))

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], title = "foo", legend_gp = gpar(fill = 1:6))

连续颜色映射的离散图例：

at = seq(0, 1, by = 0.2)
lgd = Legend(at = at, title = "foo", legend_gp = gpar(fill = col_fun(at)))

标题位置：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], title = "foo", legend_gp = gpar(fill = 1:6),
    title_position = "lefttop")

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], title = "foo", legend_gp = gpar(fill = 1:6),
    title_position = "leftcenter-rot")

大小由 grid_width 和 grid_height 控制：

lgd = Legend(at = 1:6, legend_gp = gpar(fill = 1:6), title = "foo", 
    grid_height = unit(1, "cm"), grid_width = unit(5, "mm"))

标签的图形参数由 labels_gp 控制：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], legend_gp = gpar(fill = 1:6), title = "foo", 
    labels_gp = gpar(col = "red", fontsize = 14))

标题的图形参数由 title_gp 控制：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], legend_gp = gpar(fill = 1:6), title = "foo", 
    title_gp = gpar(col = "red", fontsize = 14))

标题和标签整合 gridtext 包的复杂文本：

lgd = Legend(
    title = gt_render("<span style='color:orange'>**Legend title**</span>"), 
    title_gp = gpar(box_fill = "grey"),
    at = c(-3, 0, 3), 
    labels = gt_render(c("**negative** three", "*zero*", "**positive** three")),
    legend_gp = gpar(fill = 1:3)
)

网格的边界由 border 控制：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], legend_gp = gpar(fill = 1:6), title = "foo", 
    border = "red")

离散图例可以将网格排列成多行或/和多列。如果 ncol 设置为数字，则网格将排列为 ncol 列：

lgd = Legend(labels = month.name[1:10], legend_gp = gpar(fill = 1:10), 
    title = "foo", ncol = 3)

仍然根据多列图例计算标题位置：

lgd = Legend(labels = month.name[1:10], legend_gp = gpar(fill = 1:10), title = "foo", 
    ncol = 3, title_position = "topcenter")

通过设置 by_row = TRUE 来选择按行排列：

lgd = Legend(labels = month.name[1:10], legend_gp = gpar(fill = 1:10), title = "foo", 
    ncol = 3, by_row = TRUE)

两列之间的间隙由 gap 或 column_gap 控制。这两个参数的处理方式相同：

lgd = Legend(labels = month.name[1:10], legend_gp = gpar(fill = 1:10), title = "foo", 
    ncol = 3, gap = unit(1, "cm"))

行之间的间隙由 row_gap 控制：

lgd = Legend(labels = month.name[1:10], legend_gp = gpar(fill = 1:10), title = "foo", 
    ncol = 3, row_gap = unit(5, "mm"))

除了 ncol，还可以通过 nrow 指定布局。请注意，不能同时使用 ncol 和 nrow：

lgd = Legend(labels = month.name[1:10], legend_gp = gpar(fill = 1:10), 
    title = "foo", nrow = 3)

一种极端情况是所有级别都 放在一排 并且标题旋转 90 度。图例的高度将是旋转标题的高度：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], legend_gp = gpar(fill = 1:6), title = "foooooo", 
    nrow = 1, title_position = "lefttop-rot")

很多人可能会喜欢以下风格：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], legend_gp = gpar(fill = 1:6), title = "foooooo", 
    nrow = 1, title_position = "leftcenter")

Legend() 还支持使用简单的图形（例如点、线、箱线图）作为图例。type 参数可以指定为 points 或 p，可以使用数字表示 pch 或单字母表示 pch：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], title = "foo", type = "points", 
    pch = 1:6, legend_gp = gpar(col = 1:6), background = "#FF8080")

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], title = "foo", type = "points", 
    pch = letters[1:6], legend_gp = gpar(col = 1:6), background = "white")

或者设置 type = "lines"/type = "l" 使用线条作为图例：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], title = "foo", type = "lines", 
    legend_gp = gpar(col = 1:6, lty = 1:6), grid_width = unit(1, "cm"))

或设置 type = "boxplot"/type = "box" 以使用箱线图作为图例：

lgd = Legend(labels = month.name[1:6], title = "foo", type = "boxplot",
    legend_gp = gpar(fill = 1:6))

当 pch 为整数时，26:28 中的数字对应以下符号：

lgd = Legend(labels = paste0("pch = ", 26:28), type = "points", pch = 26:28)

在上面显示的所有示例中，标签都是单行。还支持多行标签。如以下示例所示，多线标签的图例网格会自动延长：

lgd = Legend(labels = c("aaaaa\naaaaa", "bbbbb\nbbbbb", "c", "d"),
    legend_gp = gpar(fill = 1:4))

如果图例排列成多行或多列，则图例网格的大小将调整为行数最多的标签：

lgd = Legend(labels = c("aaaaa\naaaaa", "c", "d", "bbbbb\nbbbbb"),
    legend_gp = gpar(fill = 1:4), nrow = 2)

最后一个有用的参数图形可用于自定义图例图形。图形的值应该是带有四个参数的函数列表：x 和 y：图例网格的中心，w 和 h：图例网格的宽度和高度。图形的长度应与 at 或标签相同。如果图形是名称与标签相对应的命名列表，则图形列表的顺序会自动调整：

lgd = Legend(labels = letters[1:4],
    graphics = list(
        function(x, y, w, h) grid.rect(x, y, w*0.33, h, gp = gpar(fill = "red")),
        function(x, y, w, h) grid.rect(x, y, w, h*0.33, gp = gpar(fill = "blue")),
        function(x, y, w, h) grid.text("A", x, y, gp = gpar(col = "darkgreen")),
        function(x, y, w, h) grid.points(x, y, gp = gpar(col = "orange"), pch = 16)
    ))

未完待续。

收官！

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